Pages
-
-
Popunjavanje rupa sastavljenih genoma pomoću dugačkih očitanja
-
Ivan Krpelnik U ovom radu implementiran je alat za produljivanje i povezivanje sastavljenih slijedova u programskom jeziku C++. Alat je nazvan Ezra i potencijalno bi se mogao koristiti za produljivanje i povezivanje u alatu za de novo sastavljanje Rala. Metode produljivanja i povezivanja bi se trebale izvršavati iterativno, ponavljajući proces sve dok ima valjanih produljenja i povezivanja.
Alat je testiran na umjetno generiranim slijedovima napravljenih nasumičnim rezanjem genoma e. coli i na...
-
-
Popunjavanje rupa u djelomično sastavljenom genomu
-
Marija Oreč U današnje vrijeme, uređaji za postupak sekvenciranja ograničeni su na očitanje manjih dijelova s određenom pogreškom. Pošto ne sekvenciraju cijele genome, jedan od glavnih zadataka u bioinformatici jest sastavljanje cijelog genoma na temelju nastalih očitanja. Razvijeni alati za ovaj problem za velike genome sastavljaju manje dijelove koje nazivamo djelomično sastavljenim fragmentiranim genomima. Potrebno je razviti dodatne alate za poboljšanje takvih djelomično sastavljenih...
-
-
Poravnanje RNA očitanja na poznate gene
-
Ivan Krpelnik RNA sekvenciranje je metoda za analizu transkriptoma. Analizom transkriptoma u
nekom trenutku dobivamo uvid u stanje organizma i mogućnost identificiranja
regija genoma koje su odgovorne za različite funkcije. U ovom radu je prikazano
proširenje alata u svrhu poravnanja RNA očitanja na poznate gene.
Osim toga, opisani su osnovni mehanizmi u sekvenciranju nanoporama, te neke
druge tehnologije korištene za sekvenciranje i poravnanje. Dan je i pregled
formata datoteka koje su korištene za...
-
-
Poravnanje dugačkih RNA očitanja
-
Antonio Jurić Poravnanje dugačkih RNA očitanja jest problem pronalska s kojeg dijela reference je nastalo dobiveno RNA očitanje. Problem se razlikuje od poravnanja DNA nizova u kojem želimo sastaviti cjelokupni genom zbog posebnih stvojstava RNA koja bitno kompliciraju cijeli proces. U ovom radu opisana je problematika poravnanja nizova RNA. Alat za poravnanje nizova GraphMap problem poravnanja nizova RNA rješava u pet faza: posljednju fazu obrađuje ovaj rad. U toj fazi pokušavamo pronaći najbolje...
-
-
Poravnanje genoma korištenjem skrivenog Markovljevog modela
-
Jurica Kuleš U zadnjih nekoliko desetljeća, došlo je do značajnih pomaka u području genomike, ponajviše zahvaljujući bioinformatičkoj analizi, čiji je najčešći početni korak poravnanje genoma. U ovom radu naveo sam osnovne biološke pojmove iz područja genomike, predstavio osnovne mjere udaljenosti između bioloških sljedova te opisao Needleman-Wunschov algoritam za dobivanje optimalnog poravnanja dvaju sljedova. Najveći fokus bio je na matematičkom konceptu skrivenog Markovljevog...
-
-
Poravnavanje višejezičnih reprezentacija radi postizanja boljih rezultata na međujezičnom zaključivanju
-
Marko Rajnović Višejezično poravnavanje predstavlja jezične vektore više jezika u istom jezičnom prostoru, na način da su semantički slični vektori različitih jezika blizu u vektorskom prostoru. Naš zadatak je bio istražiti ima li poravnavanje utjecaja na performanse modela na naknadnim zadacima te poravnavaju li modeli jezike ako se treniraju u paradigmi "prevedi pa treniraj". Nakon toga treniramo poravnavanje na podacima koji su unutar domene zadataka da pobjedimo osnovne modele. Vizualiziramo...
-
-
Porodica protokola za dvosmjernu distribuciju podataka u bežičnim mrežama LoRa
-
Mia Orešković U ovome radu opisana je bežična tehnologija LoRa, te parametri fizičkog sloja na kojima se temelji navedena tehnologija. Također dan je kratak pregled postojećeg protokola komunikacije pod nazivom LoRaWAN kao i njegove karakteristike. Napravljene su simulacije različitih kombinacija parametara fizičkog sloja, te su rezultati prikazani u obliku grafova. Predložena je porodica protokola za LoRa komunikaciju te je vrednovana simulatorom FloRa, koji se temelji na radnom okviru za...
-
-
Portal o knjigama
-
Martina Kožul U sklopu rada razvijen je portal za knjige kao Android aplikacija pisana programskim jezikom Kotlin u razvojnom okruženju Android Studio. Za spremanje i sinkronizaciju podataka o knjigama i korisnicima te autentifikaciju korisnika koristi se Firebase. Portal omogućuje agregaciju podataka, pretraživanje knjiga, pisanje recenzija, upravljanje favoritima i, po uzoru na društvene mreže, praćenje drugih korisnika.
-
-
Portfelji minimalne varijance pod investicijskim ograničenjima
-
Jakov Viktor Munjiza Portfelji minimalne varijance su vrste investicijskih strategija u kojima je primarni cilj osigurati minimalan rizik za investitora. Cilj ovog završnog rada bio je istražiti portfelje minimalne varijance pod različitim investicijskim ograničenjima. Implementacija portfelja je postignuta uz korištenje kovarijantne matrice. Optimizacijski postupak proveli smo bez ograničenja, a zatim pod financijskim ograničenjima: bez dozvoljenog skraćivanja, restrikcija maksimalnog ulaganja od 15% u...
-
-
Portfelji minimalne varijance pod investicijskim ograničenjima u jednofaktorskom modelu
-
Nika Kovačević Portfelji minimalne varijance predstavljaju portfelje koji nose najmanji mogući rizik za investitore. Jednofaktorskim modelom se pojednostavljuje postupak određivanja tih portfelja te se ubrzava proces optimizacije. Cilj ovog završnog rada bio je odrediti performanse portfelja minimalne varijance, pod raznim investicijskim ograničenjima, podrazumijevajući pritom jednofaktorski model. Za analizu je prvo razvijen jednofaktorski model pri čemu je burzovni indeks S&P 500 predstavljao...
-
-
Posljedice ispusta plinovitog radiaktivnog materijala iz nuklearne elektrane na okoliš
-
Matea Filipović Analiza nuklearne sigurnosti ključna je za razvoj nuklearne energetike. Tijekom akcidenta u nuklearnoj elektrani dolazi do oštećenja goriva. Iz goriva se oslobađaju radioaktivni elementi u kontejment i grupiraju se u kategorije po sličnim svojstvima. Nakon oslobađanja iz elektrane radioaktivni ispust se promatra u dozama te se prati njegova disperzija u okoliš. Neki učinci primljenih doza ne mogu se vidjeti odmah već je za to potreban dulji vremenski period. Vrlo je važno...
-
-
Posljedice odustajanja od nuklearnog energetskog programa u Njemačkoj
-
Marko Medved U ovom radu obrađene su situacije u svijetu koje su dovele do odluke Njemačke o izlasku iz nuklearnog programa. Posljedice te odluke komentirane su i obrađene prema dospunim podatcima i uspoređene prema slijedećim kriterijima:
• Distribucija proizvodnje električne energije prema gorivu
• Cijena električne energije za kućanstva
• Cijena električne energije za industriju
• Cijena električne energije na spot tržištu
• Proizvodnja CO2
Nakon usporedbe navedenih kriterija,...
Pages