Web aplikacija za vizualizaciju bioinformatičkih algoritama

diplomski rad

• Naslov (engleski): Web application for bioinformatic algorithm visualisation
• Autor: Mario Klaić
• Mentor: Krešimir Križanović (mentor)
• Član povjerenstva: Krešimir Križanović (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Boris Milašinović (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Mirjana Domazet-Lošo (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Fakultet elektrotehnike i računarstva; Zagreb
• Datum i država obrane: 2024-09-19, Hrvatska

Sažetak

Ovaj diplomski rad predstavlja edukativni alat dizajniran za poboljšanje iskustva učenja za studente na kolegiju Bioinformatika 1 na Fakultetu elektrotehnike i računarstva (FER).
Projekt uključuje interaktivnu web-aplikaciju koja vizualno prikazuje korake ključnih bioinformatičkih algoritama, kao što su globalno poravnanje (Needleman-Wunsch), minimizeri (LCS i LIS), sufiksna stabla (Ukkonenov algoritam), sufiksna polja (SA-IS) i FM indeks. Omogućujući detaljne, korak-po-korak vizualizacije i unos korisničkih podataka, alat ima za cilj učiniti složene bioinformatičke koncepte pristupačnijima studentima, čime se poboljšava njihovo razumijevanje i angažman u predmetu.

Sažetak (engleski)

This thesis presents an educational tool designed to enhance the learning experience for students enrolled in the Bioinformatics 1 course at the Faculty of Electrical Engineering and Computing (FER).
The project includes an interactive web-based application that visually demonstrate the steps of key bioinformatics algorithms, such as global alignment (Needleman-Wunsch), minimizers (LCS and LIS), suffix trees (Ukkonen's algorithm), suffix arrays (SA-IS), and the FM index. By providing detailed, step-by-step visualizations and allowing user input, the tool aims to make complex bioinformatics concepts more accessible for students, thereby improving their comprehension and engagement with the subject matter.

• Ključne riječi: Bioinformatika 1; Algoritmi; Interaktivno korisničko sučelje; Web aplikacija
• Ključne riječi (engleski): Bioinformatics 1; Algorithms; Interactive user interface; Web application
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:168:193519
• Studijski program: Naziv: Računarstvo; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Zatvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2024-10-12 21:04:04