Pages
-
-
De novo sastavljanje genoma vođeno referencom
-
Sara Bakić De novo sastavljanje genoma jedan je od najkompleksijih problema u bioinformatici. Brojni su problemi prilikom sastavljanja genoma, uzrokovani, kako biološkim specifičnostima, tako i greškama u procesu sekvenciranja. Probleme stvaraju takozvana ponavljajuća i kimerna očitanja. U ovom radu prikazano je kako detektiranje kimernih i ponavljajućih očitanja uz prikladna postupanja s njima pomaže ispravnom sastavljanju genoma. Prikazane su poteškoće na koje se nailazi prilikom...
-
-
De novo sastavljanje metagenoma koristeći metode za grupiranje očitanja
-
Luka Škugor Kod metagenomskog sastavljanja, suočeni smo s mnogim dodatnim izazovima u odnosu na sastavljanje jednog genoma.
U ovom radu, pokušali smo riješiti ove probleme grupiranjem segmenata koje proizvode alati treće generacije za sekvenciranje.
U idealnom slučaju, to bi omogućilo korištenje postojećih de novo alata za sastavljanje genoma na metagenomskom uzorku.
Naša implementacija grupiranja je donekle poboljšala postojeće alate za de novo sastavljanje kod primjene na metagenomskom...
-
-
De novo sastavljanje metagenomskih podataka korištenjem grupiranja podataka temeljenih na Bayesovom modelu
-
Mirta Dvorničić Mikrobne zajednice utječu na gotovo svaki aspekt našeg života. Metagenomika nastoji otkriti nove spoznaje o tim zajednicama analizom DNA uzoraka izuzetih direktno iz njihovih okoliša. Metagenomska istraživanja se i dalje uglavnom oslanjaju na ručne intervencije i alate namijenjene za sastavljanje genomskih podataka koji ne uzimaju u obzir specifičnosti metagenomskih podataka. U ovom radu je predstavljena metoda za de novo sastavljanje metagenomskih podataka korištenjem grupiranja...
-
-
De novo sastavljanje mikrobnih zajednica koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije
-
Tvrtko Brekalo Tehnologija treće generacije sekvenciranja otvorila je vrata novim procedurama de novo sastavljanja genoma sa svojim dugačkim očitanjima relativno višeg postotka pogreške. Nažalost,
napredak tehnologije sekvenciranja nije još u potpunosti popraćen od strane asemblera, programa čija je zadaća sastavljanje genoma. Većina današnjih asemblera dizajnirana je za skupove podataka koji sadrže jedan manji organizam. Prilikom skeniranja uzorak iz vode, crijeva, zemlje i slično, dolazi...
-
-
De novo sastavljanje transkriptoma
-
Robert Vaser U ovom radu, implementiran je de novo asembler transkriptoma koji je baziran na preklapanje-razmještaj-konsenzus paradigmi. Napisan je u programskom jeziku C++ i imenovan je Ra što je skraćeno od RNA asembler. Faza preklapanja bazirana je na poboljšanom sufiksnom polju i reproducira egzaktna preklapanja između ulaznih očitanja. Faza razmještaja koristi nekoliko metoda za pojednostavljenje grafova koji su izgrađeni nad očitanjima i njihovim preklapanjima. Kako faza preklapanja...
-
-
Decentralizirana metoda za planiranje razmjene energije u multi - robotskom sustavu
-
Sara Boljunčić Razmjeni energije u multi-robotskom sustavu pristupa se kreiranjem rasporeda punjenja između agenata. Ovaj rad istražuje dva pristupa kreiranju rasporeda.
Prvi pristup je decentralizirano generiranje rasporeda uz pomoć TAEMS jezika. Agenti u sustavu razmjenjuju podatke i pronađena rješenja rasporeda. Konačno rješenje je ono oko kojeg se svi agenti usuglase.
Drugi pristup je centralizirana verzija. Izabrani agent sudjeluje u pronalaženju rješenja pomoću metaheurističkog...
-
-
Decentralizirana mjenjačnica kriptovaluta temeljena na bazenu likvidnosti
-
Fran Vlahović U ovom radu analiziran je pojam decentralizirane mjenjačnice uz primjer implementacije s funkcionalnošću bazena likvidnosti. Dan je opis blok-lanca, kriptovalute Ethereum, decentralizirane aplikacije i pametnih ugovora. Objašnjeno je koje su prednosti i nedostaci centraliziranih i decentraliziranih mjenjačnica. U zasebnim poglavljima razrađeno je kako one funkcioniraju. Kao funkciju DEX-a, objašnjen je automatizirani pružatelj likvidnosti. Na kraju prikazan je primjer primjene DEX-a...
-
-
Decentralizirana platforma za nagrađivanje nezavisnog stvaralaštva temeljena na kriptovaluti Nano
-
Toma Šimunić Platforme za nagrad¯ivanje nezavisnog stvaralaštva nude korisnicima financiranje
u zamjenu za sadržaj. Te platforme prihva´caju konvencionalne valute ili kriptovalute
i koriste razliˇcite poslovne modele. Obrada transakcija izvršenih konvencionalnim
kriptovalutama ne dozvoljava korisniku da prima valutu bez posrednika, što poskupljuje
izvršavanje transakcije. Kriptovalute koje omogu´cuju adrese sa više potpisa
omoguc´avaju da korisnik u svakom trenutku obrade transakcije...
-
-
Decentralizirana strategija kooperativnog istraživanja prostora pomoću višerobotskog sustava
-
Ana Batinović U radu je implementirano decentralizirano višerobotsko istraživanje prostora temeljeno na Graph SLAM metodi i brzorastućim slučajnim stablima uz korištenje mobilnih robota Pioneer P3-DX. Algoritam istraživanja prostora uključuje detekciju točaka fronte temeljenu na RRT algoritmu i nadograđenu za Graph SLAM, filtriranje detektiranih točaka i dodjeljivanje ciljnih točaka robotima koristeći decentraliziranu strategiju temeljenu na market modelu koja minimizira vrijeme potrebno za...
-
-
Decentralizirano raspoređivanje zadataka za više vozila
-
Ivan Hrabar Tijekom ovog završnog rada simulacijski je ispitano decentralizirano raspoređivanje zadataka za više vozila. Teoretski je proučeno određivanje cijene pojedine misije te je definiran izračun cijene. Određivanje cijene misije implementirano je u multi-AGV programski paket. Izvedeno je proširenje postojećeg multi-AGV programskog paketa omogućujući simuliranje rada decentraliziranog raspoređivanja zadataka za više vozila. Proučen je Munkresov algoritam te je implementiran za...
-
-
Decentralizirano upravljanje heterogenim robotskim sustavom
-
Barbara Arbanas Pronalaženje metoda za ostvarivanje koherentnog, robusnog i prilagodljivog ponašanja skupina autonomnih robota je jedan od najvećih problema s područja robotike. U ovom radu koristi se generički pristup po uzoru na GPGP model koji omogućava uspješnu kordinaciju heterogenog sustava robota neovisno o domeni problema koji se rješava. Hijerarhijski prikaz problema jezikom T\AE MS pruža bogatu definiciju strukture zadataka te podržava definiranje složenih međuovisnosti zadataka....
-
-
Decentralizirano upravljanje jatom robota korištenjem potpornog strojnog učenja
-
Lovro Gotovac Svrha ovog rada bila je, koristeći potporno učenje, naučiti jednog agenta (studenta) da se ponaša kao drugi agenti u jatu (učitelji) koji koriste Reynoldsova pravila. Odnosno, cilj je bio istrenirati kontroler temeljen na potpornom učenju koji se uči ``promatrajući'' izlaze iz Reynoldsovog kontrolera. U radu je dan kratki sažetak onih Reynoldsovih pravila korištenih za kontroler, kohezija, separacija, poravnanje i izbjegavanje prepreka. Također, dan je i sažetak potpornog...
Pages
