3D segmentacija CT snimaka bubrežnog kamenca

diplomski rad

• Naslov (engleski): 3D segmentation of kidney stone CT images
• Autor: Matea Đonlić
• Mentor: Damir Seršić (mentor)
• Član povjerenstva: Damir Seršić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Mladen Vučić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Marko Subašić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Fakultet elektrotehnike i računarstva; Zagreb
• Datum i država obrane: 2014-07-09, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: TEHNIČKE ZNANOSTI; Računarstvo

Sažetak

Ovaj diplomski rad usmjeren je na implementaciju i usporedbu različitih metoda 3D segmentacije s primjenom na problem segmentacije CT snimaka bubrežnog kamenca.
Budući da se sve metode 3D segmentacije provode nad diskretnom trodimenzionalnom rešetkom, ulazni podaci (skup datoteka u DICOM formatu) obrađeni su i oblikovani tako da je omogućen odabir područja interesa i iz njega stvaranje diskretne rešetke.
U sklopu rada, implementirane su metode amplitudne segmentacije, segmentacije izrastanjem područja te segmentacije temeljene na lokalnoj faznoj koherenciji. Kao ocjena uspješnosti segmentacije korištena je mjera sličnosti između napravljenog modela i referentnog modela izvađenog kamenca. Mjera sličnosti dobivena je provođenjem postupka registracije modela korištenjem ICP algoritma. Također, napravljena je usporedba s rezultatima segmentacija provedenih korištenjem dostupnih programskih alata za 3D medicinsku segmentaciju. Napravljena je i usporedba brzine izvođenja implementiranih segmentacija te ocjena uspješnosti segmentacija u ovisnosti o subjektivnim odabirima područja interesa.

Sažetak (engleski)

This thesis focuses on the implementation and comparison of different 3D segmentation methods along with their application to the medical problem of kidney stone CT image segmentation.
Considering the fact that the all segmentation methods require a discrete three-dimensional grid, the input data in DICOM format had to be processed and shaped in the form suitable for the process of region of interest (ROI) selection and the creation of the three-dimensional grid.
Three 3D segmentation methods were presented and implemented in this thesis -- an amplitude segmentation method, a region growing segmentation and a segmentation method based on the local phase coherence. For the evaluation of implemented segmentation methods, created models were compared with surgically removed kidney stone and also with the models created using few of the available software tools for 3D medical segmentation. Models were compared based on the similarity measure obtained via ICP algorithm. Also, an execution time analysis for different segmentation methods was made as well as the comparison of the segmentation performance depending on the subjective choices of ROI.

• Ključne riječi: automatska 3D segmentacija; amplitudna segmentacija; izrastanje područja; lokalna fazna koherencija; ICP algoritam
• Ključne riječi (engleski): automatic 3D segmentation; amplitude thresholding; region growing; local phase coherence; ICP algorithm
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:168:144249
• Studijski program: Naziv: Informacijska i komunikacijska tehnologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka informacijske i komunikacijske tehnologije (mag. ing. inf. et comm. techn.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Zatvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2018-02-06 08:38:46