prikaz prve stranice dokumenta Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom
Rad nije dostupan
diplomski rad
Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom
2015. urn:nbn:hr:168:352075
Čulinović, Marko
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Citirajte ovaj rad

Čulinović, M. (2015). Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Čulinović, Marko. "Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Čulinović, Marko. "Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Čulinović, M. (2015). 'Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 11.04.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Čulinović M. Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2015 [pristupljeno 11.04.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

M. Čulinović, "Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2015. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovPopravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom
Naslov (engleski)Scaffolding Using Long Error-Prone Reads
AutorMarko Čulinović
MentorMile Šikić (mentor)
Član povjerenstvaMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDamir Seršić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMladen Vučić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2015-07-03, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
Popravljanje postojećih genoma koristeći dugačka očitanja s velikom greškom obećavajući je pristup za popunjavanje rupa u nedovršenim genomima. Dvije metode predložene su za produljivanje kontiga. Prva se temelji na lokalnom i globalnom poravnanju očitanja koja su moguća produljenja kontiga, a druga koristi POA algoritam za generiranje konsenzus sekvence iz tih očitanja. Rad metoda testiran je na dva različita skupa podataka dugačkih očitanja - PacBio i Oxford Nanopore Technologies očitanja. Projekt je implementiran u programskom jeziku C++.
Sažetak (engleski)
Scaffolding using long error-prone reads is very promising method for completion of draft genomes. Two methods were proposed for extending contigs in draft genomes. First one is based on local and global realignment of possible extension reads and second one uses POA algorithm for generating consensus sequence from these reads. Program was tested on two different types of long reads, PacBio and Oxford Nanopore Technologies. Project is implemented in C++ programming language.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:352075
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2018-02-06 08:19:46