Automatsko praćenje parametara oblika stanica u mikroskopskim snimkama

diplomski rad

• Naslov (engleski): Automated Tracking of Cell Shape Parameters in Microscopic Sequences
• Autor: Matea Torbarina
• Mentor: Igor Lacković (mentor)
• Član povjerenstva: Igor Lacković (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Ratko Magjarević (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Darko Vasić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Fakultet elektrotehnike i računarstva; Zagreb
• Datum i država obrane: 2019-07-10, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: TEHNIČKE ZNANOSTI; Računarstvo
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: TEHNIČKE ZNANOSTI; Elektrotehnika

Sažetak

Automatsko praćenje mikroskopskih slika omogućuje jednostavnu i učinkovitu analizu stanica koje se na njima nalaze. Praćenje ponašanja matičnih stanica posebno je zanimljivo zbog njihovog velikog potencijala u liječenju raznih bolesti, stoga bi algoritam koji ima mogućnost praćenja stanica i određivanja njihovih parametara bio od velike koristi. Cilj ovog rada bio je razviti algoritam za praćenje jednog ili više objekata u videozapisu, razviti korisničko sučelje za prikaz praćenja objekta te razviti algoritme za mjerenje površine i opsega oblika objekata, što je uspješno ostvareno. Kao ulazni podaci korišteni su sintetski generiran videozapis te snimke stanica. Prilikom ispitivanja, algoritam se pokazao uspješnim, međutim neki od slučajeva kao što su promjena razlučivosti slike, šum na slici, promjena oblika praćenog objekta, uspjeli su omesti njegov rad.

Sažetak (engleski)

Automatic tracking of microscopic images makes the cell analysis much easier and efficient. Stem cells tracking is very interesting because stem cells have large potential to cure various diseases. Because of that, an algorithm with ability of tracking cells and extracting cell parameters would be huge progress in biomedical area. The goal of this work was to develop the cell tracking algorithm for tracking one or more objects in video and extracting cell parameters and also to develop the user interface to display the tracking procedure. The synthetically generated video and stem cell video were used as an input data for algorithm testing. During the testing, the algorithm proved to be successful, but some of input data changes such as resolution change, noise presence in image and shape changes of tracking object, disrupted its work.

• Ključne riječi: automatsko; pra ́cenje; pokretni objekti; stanice
• Ključne riječi (engleski): automatic; tracking; moving objects; cells
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:168:486075
• Studijski program: Naziv: Elektrotehnika i informacijska tehnologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka elektrotehnike i informacijske tehnologije (mag. ing. el. techn. inf.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Zatvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2020-01-07 22:43:10