Preklapanje visoko pouzdanih očitanja diploidnih ili poliploidnih organizama

završni rad

• Naslov (engleski): Overlap of high-fidelity reads of diploid or polyploid organisms
• Autor: Filip Vučenik
• Mentor: Mile Šikić (mentor)
• Član povjerenstva: Mile Šikić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Josipa Lipovac (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Filip Tomas (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Fakultet elektrotehnike i računarstva; Zagreb
• Datum i država obrane: 2024-07-04, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: TEHNIČKE ZNANOSTI; Računarstvo

Sažetak

Ovaj završni radi bavi se pronalaženjem informativnih pozicija i njihovim korištenjem
za predviđanje haplotipova u preklapanjima očitanja genoma diploidnih organizama.
U završnom radu je dan pregled osnovnih tehnologija sekvenciranja te primjeri alata za
simulaciju sekvenciranja. Objašnjene su metode računanja preklapanja sekvenciranih očitanja te je dan uvid u računanje informativnih pozicija.

Sažetak (engleski)

This final thesis deals with finding informative positions and using them to predict hap-
lotypes in the overlaps of genome reads of diploid organisms.
Thesis provides an overview of basic sequencing technologies and examples of tools for se-
quencing simulation. Here are explained methods for calculating overlaps of sequenced
reads, and insights into the calculation of informative positions are provided.

• Ključne riječi: informativne pozicije; preklapanja; algoritmi
• Ključne riječi (engleski): informative positions; overlaps; algorithms
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:168:132156
• Studijski program: Naziv: Računarstvo; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: preddiplomski; Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (univ.bacc.ing.comp.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Zatvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2024-10-12 22:28:10