Web aplikacija za pohranjivanje i pretraživanje bioinformatičkih podataka

diplomski rad

• Naslov (engleski): Web Application for Storing and Querying Bioinformatics Data
• Autor: Nikola Špoljarec
• Mentor: Krešimir Križanović (mentor)
• Član povjerenstva: Krešimir Križanović (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Igor Mekterović (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Boris Milašinović (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Fakultet elektrotehnike i računarstva; Zagreb
• Datum i država obrane: 2023-09-22, Hrvatska

Sažetak

U ovom radu uspješno je razvijena web aplikacija za pohranjivanje i pretraživanje bioinformatičkih podataka. Koristeći MongoDB kao bazu podataka, Spring Boot za backend i React za frontend, stvoreno je efikasno i sigurno okruženje za unos, upravljanje i pretraživanje podataka.
Omogućeno je pretraživanje organizama u klaster bazi podataka, ispis referenci i mapiranja vezanih za određeni organizam te preuzimanje referenci za traženi organizam s NCBI stranice.
Razumijevanje bioinformatičkih podataka i primjena tehnologija omogućili su razvoj korisnog alata za analizu i istraživanje, unapređujući rad znanstvene zajednice u području bioinformatike.

Sažetak (engleski)

In this study, a successful web application for storing and searching bioinformatic data has been developed. By utilizing MongoDB as the database, Spring Boot for the backend, and React for the frontend, an efficient and secure environment for data input, management, and retrieval has been created.
The application enables searching organisms in the cluster database, displaying references and mappings associated with a specific organism, and downloading references from the NCBI website.
The understanding of bioinformatic data and the application of technologies have facilitated the development of a valuable tool for analysis and research, enhancing the work of the scientific community in the field of bioinformatics.

• Ključne riječi: bioinformatika; referenca; očitanje; mapiranje; k-mer analiza; mongo baza podataka; dokument; kolekcija; Spring Boot; React; komponenta
• Ključne riječi (engleski): bioinformatics; reference; reading; query; k-mer analysis; MongoDB database; document; collection; Spring Boot; React; component
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:168:525049
• Studijski program: Naziv: Računarstvo; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Zatvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2023-10-11 10:41:50