Aplikacija za pohranjivanje i vizualizaciju bioinformatičkih podataka

diplomski rad

• Naslov (engleski): An Application for Visualizing and Storing Bioinformatics Data
• Autor: Nikola Osredek
• Mentor: Krešimir Križanović (mentor)
• Član povjerenstva: Krešimir Križanović (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Marko Subašić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Igor Mekterović (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Fakultet elektrotehnike i računarstva; Zagreb
• Datum i država obrane: 2022-07-13, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: TEHNIČKE ZNANOSTI; Računarstvo

Sažetak

U ovom radu napravljena je aplikacija koja može pohranjivati par vrsti bioinformatičkih podataka. Podaci koji su uključeni su referentni genomi, očitanja iz uređaja za sekvenciranje i mapiranja tih očitanja. Sve podatke se može pretraživati po različitim parametrima te se mapirana očitanja mogu vizualizirati. Aplikacija je napravljena kao web aplikacija koja podržava više korisnika.

Sažetak (engleski)

The result of this paper is a web application for saving a few types of bioinformatic data. Data which is possible to add includes references of genomes, reads from sequencing machines and mappings of those reads. All the data can be searched by different parameters and the mapped reads can be visualized. The application is made as a web application that supports multiple users.

• Ključne riječi: C#; ASP.NET Core; Vue.js; bioinformatika; DNA sekvenciranje; mapiranje
• Ključne riječi (engleski): C#; ASP.NET Core; Vue.js; bioinformatics; DNA sequencing; mapping
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:168:685290
• Studijski program: Naziv: Računarstvo; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Zatvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2023-01-13 15:45:33