Sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma

završni rad

• Naslov (engleski): Referential genome compression
• Autor: Magdalena Palić
• Mentor: Mirjana Domazet-Lošo (mentor)
• Član povjerenstva: Mirjana Domazet-Lošo (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Ivica Botički (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Tomislav Jagušt (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Fakultet elektrotehnike i računarstva; Zagreb
• Datum i država obrane: 2024-06-20, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: TEHNIČKE ZNANOSTI; Računarstvo

Sažetak

Zbog sve veće potrebe za sažimanjem genoma poradi smanjenja porstora potrebnog za pohranu istoga. Ovaj rad se bavi SCCG algoritmom za sažimanje skupa genoma pomoću referentnog genoma. U radu će se predstaviti implementacija ovoga algoritma, kompresija genoma i dekompresija genoma.

Sažetak (engleski)

Due to the growing need to compress the genome due to the reduction of the space required to store it. This paper deals with the SCCG algorithm for genome set compression using a reference genome. The paper will present the implementation of this algorithm, genome compression and genome decompression.

• Ključne riječi: kompresija genoma; referentni genom; SCCG; tablica raspršenog adresiranja; k-meri
• Ključne riječi (engleski): genome compression; reference genome; SCCG; hash table; k-mer
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:168:149953
• Studijski program: Naziv: Računarstvo; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: preddiplomski; Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (univ.bacc.ing.comp.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2025-02-25 12:57:56