pid,type,title,authors,mentors,source_title,published_date,url,doi,isbn,issn,eissn
fer:13359,"journal article","A systematic benchmark of Nanopore long-read RNA sequencing for transcript-level analysis in human cell lines","Chen, Ying; Davidson, Nadia M.; Wan, Yuk Kei; Yao, Fei; Su, Yan; Gamaarachchi, Hasindu; Sim, Andre; Patel, Harshil; Low, Hwee Meng; Hendra, Christopher; Wratten, Laura; Hakkaart, Christopher; Sawyer, Chelsea; Iakovleva, Viktoriia; Lee, Puay Leng; Xin, Lixia; Ng, Hui En Vanessa; Loo, Jia Min; Ong, Xuewen; Ng, Hui Qi Amanda; Wang, Jiaxu; Koh, Wei Qian Casslynn; Poon, Suk Yeah Polly; Stanojevic, Dominik; Tran, Hoang-Dai; Lim, Kok Hao Edwin; Toh, Shen Yon; Ewels, Philip Andrew; Ng, Huck-Hui; Iyer, N. Gopalakrishna; Thiery, Alexandre; Chng, Wee Joo; Chen, Leilei; DasGupta, Ramanuj; Sikic, Mile; Chan, Yun-Shen; Tan, Boon Ooi Patrick; Wan, Yue; Tam, Wai Leong; Yu, Qiang; Khor, Chiea Chuan; Wüstefeld, Torsten; Lezhava, Alexander; Pratanwanich, Ploy N.; Love, Michael I.; Goh, Wee Siong Sho; Ng, Sarah B.; Oshlack, Alicia; Iyer, N. Gopalakrishna; Yu, Qiang; Göke, Jonathan",,,,,,,,
fer:12833,thesis,"Preklapanje visoko pouzdanih očitanja diploidnih ili poliploidnih organizama","Vučenik, Filip",,,,,,,,
fer:12839,thesis,"Klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera","Vuković, Franjo",,,,,,,,
mef:10155,"journal article","The Applied Genomics Development Strategy by the Croatian Academy of Sciences and Arts paves the way for the future development of applied genomics in Croatia","Sedlic, Filip; Sertić, Jadranka; Markotić, Alemka; Primorac, Dragan; Slavica, Anita; Zibar, Lada; Vlahoviček, Kristian; Kušec, Vesna; Barić, Ivo; Paar, Vladimir; Borovečki, Fran; Žmak, Ljiljana; Kurolt, Ivan-Christian; Canki-Klain, Nina; Roksandić, Sunčana; Rinčić, Iva; Jurić, Hrvoje; Škaro, Vedrana; Marjanović, Damir; Projić, Petar; Primorac, Damir; Starčević, Antonio; Vujaklija, Dušica; Šikić, Mile; Križanović, Krešimir; Gamulin, Stjepan",,,,,,,,
fer:11655,thesis,"Ablacija dubokih neuronskih mreža za predviđanje epigenetskih modifikacija","Unković, Ivan",,,,,,,,
fer:11503,thesis,"Aktivno učenje za detekciju rijetkih epigenetskih modifikacija","Pintarić, Matija",,,,,,,,
fer:11328,thesis,"Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja","Kocijan, Martin Josip",,,,,,,,
fer:11332,thesis,"Graf neuronske mreže za de novo sastavljanje genoma","Kolić, Jan",,,,,,,,
fer:11226,thesis,"Graf neuronske mreže za traženje Hamiltonovog puta","Gaćina, Katarina",,,,,,,,
fer:9500,thesis,"Kombiniranje informacija o strukturi proteina i RNA u razvoju nove funkcije bodovanje temeljene na dubokom učenju","Martinović, Ivona",,,,,,,,
fer:9073,thesis,"Klasifikacija mikroba uporabom dubokog učenja","Pongračić, Kristijan",,,,,,,,
fer:10196,thesis,"Korištenje graf neuronskih mreža za odvajanje haplotipa u grafovima sastavljanja","Wolf, Filip",,,,,,,,
fer:8361,thesis,"Metoda za mapiranje bisulfitno tretiranih očitanja na genom","Kosier, Sanja",,,,,,,,
fer:9694,thesis,"Metoda za sastavljanje genoma temeljena na De Bruijn grafovima i minimizatorima","Yatsukha, Roman",,,,,,,,
fer:9076,thesis,"Otkrivanje lažno pozitivnih i lažno negativnih preklapanja u grafu sastavljanja","Požega, Luka",,,,,,,,
fer:9291,thesis,"Popravljanje grešaka u očitanjima čuvajući informaciju o haploidu","Brekalo, Tvrtko",,,,,,,,
fer:9994,thesis,"Poboljšanje djelomično sastavljenog genoma pomoću statističke analize Hi-C očitanja","Meter, Josip",,,,,,,,
fer:8620,thesis,"Vrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma","Šarić, Jelena",,,,,,,,
fer:9757,thesis,"Aplikacija za analizu bioinformatičkih podataka pomoću vanjskih alata","Briševac, Zvonimir",,,,,,,,
fer:8541,thesis,"Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja","Pratljačić, Suzana",,,,,,,,
fer:8401,thesis,"Detekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora","Lipovac, Josipa",,,,,,,,
fer:10077,thesis,"Aplikacija za pohranu bioinformatičkih podataka u sustavu PostgreSQL","Ranogajec, Daniel",,,,,,,,
fer:10113,thesis,"Brzo poravnanje visoko pouzdanih dugačkih očitanja","Staver, Mauro",,,,,,,,
fer:10079,thesis,"Poopćenje algoritma za poravnanje parcijalnog uređaja","Rašić, Marin",,,,,,,,
fer:9900,thesis,"Struktura podataka za efikasno spremanje očitanja dobivenih sekvenciranjem genoma","Klabučar, Ivan",,,,,,,,
fer:8143,thesis,"Brzo prepoznavanje mikroba uporabom dubokog učenja","Bakić, Sara",,,,,,,,
fer:9053,thesis,"Metoda za pretvaranje signala dobivenog sekvenciranjem nanoporama u niz nukleotida","Pavlić, Stanislav",,,,,,,,
fer:8519,thesis,"Model dubokog učenja pore za sekvenciranje nanoporama","Penić, Rafael Josip",,,,,,,,
fer:8226,thesis,"Određivanje modificiranih nukleotida koristeći sekvenciranje nanoporama i duboko učenje","Deur, Sanja",,,,,,,,
fer:8146,thesis,"Prepoznavanje mikroba uporabom dubokog učenja","Baksa, Mirna",,,,,,,,
fer:9290,thesis,"De novo sastavljanje mikrobnih zajednica koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije","Brekalo, Tvrtko",,,,,,,,
fer:9395,thesis,"Popravljanje djelomično sastavljenog genoma temeljeno na algoritmu HERA","Jurić, Matija",,,,,,,,
fer:9333,thesis,"Pronalaženje varijanti gena grupiranjem pomoću algoritama dinamičkog programiranja","Frajlić, Nera",,,,,,,,
fer:8695,thesis,"Vizualizacija podataka dobivenih sekvenciranjem RNA","Vrlec, Jan",,,,,,,,
fer:8266,thesis,"Prepoznavanje osoba i njihovih emocija u humanoidnom robotu","Gambiraža, Mate",,,,,,,,
fer:8141,thesis,"Preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja","Babojelić, Dario",,,,,,,,
fer:8508,thesis,"Prepoznavanje mikroba uporabom obrade signala i lokalno osjetljivog raspršenog adresiranja","Paulinović, Mate",,,,,,,,
fer:8094,thesis,"Sustav za praćenje ispitanika tijekom pretraživanja Google tražilicom","Šaravanja, Matej",,,,,,,,
fer:10195,thesis,"Popravljanje djelomično sastavljenoga genoma pomoći Hi-C očitanja","Wolf, Filip",,,,,,,,
fer:9693,thesis,"De novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije","Yatsukha, Roman",,,,,,,,
fer:9499,thesis,"Protočna struktura za detekciju grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora","Martinović, Ivona",,,,,,,,
fer:9035,thesis,"Vizualizacija podataka dobivenih sekvenciranjem DNA","Osredek, Nikola",,,,,,,,
fer:5836,thesis,"Procjena očekivanog stupnja potpunosti genoma iz dostupnih očitanja","Fureš, Matej",,,,,,,,
fer:6284,thesis,"Izgradnja biblioteke za poravnavanje parova dugačkih RNA očitanja","Penić, Rafael Josip",,,,,,,,
fer:6529,thesis,"Poliranje DNA slijeda koristeći metode dubokog učenja","Vrček, Lovro",,,,,,,,
fer:5629,thesis,"De novo sastavljanje genoma vođeno referencom","Bakić, Sara",,,,,,,,
fer:6330,thesis,"Gornja granica u sastavljanju genoma","Požega, Luka",,,,,,,,
fer:6367,thesis,"Klasifikacija očitanja koristeći metode dubokog učenja","Relić, Borna",,,,,,,,
fer:5781,thesis,"Korištenje referentne baze za predviđanje plazmida","Deur, Sanja",,,,,,,,
fer:6323,thesis,"Mapiranje dugačkih očitanja","Pongračić, Kristijan",,,,,,,,
fer:6267,thesis,"Mapiranje kratkih očitanja","Pavlić, Stanislav",,,,,,,,
fer:5652,thesis,"Mapiranje slijeda na graf","Batić, Dominik",,,,,,,,
fer:6073,thesis,"Ocjena alata za identifikaciju vrsta u metagenomskim uzorcima","Lipovac, Josipa",,,,,,,,
fer:6007,thesis,"Pronalaženje varijanti gena iz podataka dobivenih sekvenciranjem","Kosier, Sanja",,,,,,,,
fer:5827,thesis,"Identifikacija tipova 1D-signala dubokog učenja","Floreani, Filip",,,,,,,,
fer:6381,thesis,"Rani probir za otkrivanje preeklampsije","Rupe, Marina",,,,,,,,
fer:6639,dissertation,"Algorithms for de novo assembly of large genomes.","Vaser, Robert",,,,,,,,
fer:6652,dissertation,"Statistical inference of exogenous and endogenous information propagation in social networks.","Piškorec, Matija",,,,,,,,
fer:3110,thesis,"Poboljšanje sastavljenih genoma metodama dubokog učenja","Jurić, Antonio",,,,,,,,
fer:3697,thesis,"Naučene indeksne strukture","Paulinović, Mate",,,,,,,,
fer:2490,thesis,"Brzo pretraživanje sličnih proteinskih sljedova","Babojelić, Dario",,,,,,,,
fer:4305,thesis,"Landau-Vishkin-Nussinov algoritam za poravnanje dva niza","Vršnak, Donik",,,,,,,,
fer:2507,thesis,"Mobilna aplikacija za prikupljanje podataka o korisničkoj aktivnosti","Baksa, Mirna",,,,,,,,
fer:4001,thesis,"Približni algoritam za brzo računanje poravnanja dvaju dugačkih nizova","Sodić, Filip",,,,,,,,
fer:4267,thesis,"Raspoznavanje objekata na pametnom telefonu primjenom konvolucijskih neuronskih mreža","Vidošević, Maja",,,,,,,,
fer:4069,thesis,"Sustav za pohranu DNA","Šaravanja, Matej",,,,,,,,
fer:4129,thesis,"De novo sastavljanje metagenoma koristeći metode za grupiranje očitanja","Škugor, Luka",,,,,,,,
fer:3531,thesis,"Model dubokog učenja s kraja na kraj za određivanje očitanih baza dobivenih uređajem za sekvenciranje MinION","Miculinić, Neven",,,,,,,,
fer:3291,thesis,"Popunjavanje rupa sastavljenih genoma pomoću dugačkih očitanja","Krpelnik, Ivan",,,,,,,,
fer:4405,thesis,"Pretraživanje baza proteina pomoću djelomično uređenog poravnanja","Žuljević, Petar",,,,,,,,
fer:3951,thesis,"Skriveni Markovljev model za određivanje očitanih baza dobivenih uređajem za sekvenciranje MinION","Selak, Ana Marija",,,,,,,,
fer:2619,thesis,"Algoritam za određivanje ukupnog poravnanja dva grafa poravnanja parcijalnog uređaja","Bradač, Mislav",,,,,,,,
fer:3521,thesis,"Algoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije","Megla, Lucija",,,,,,,,
fer:3936,thesis,"Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije","Rupe, Marina",,,,,,,,
fer:4196,thesis,"Identifikacija tipova 1D-signala pomoću nenadziranog dubokog učenja","Tomljanović, Jan",,,,,,,,
fer:4087,thesis,"Identifikacija tipova 1D-signala pomoću polu-nadziranog dubokog učenja","Šebrek, Tomislav",,,,,,,,
fer:2494,thesis,"Klasifikacija bioloških anotacija na velikoj skali koristeći reprezentacije riječi izvedene iz dokumenata biomedicinske znanstvene literature","Baćac, Adriano",,,,,,,,
fer:3888,thesis,"Model dubokog učenja za određivanje očitanih baza dobivenih uređajem za sekvenciranje MinION","Ratković, Marko",,,,,,,,
fer:2854,thesis,"Ručno određivanje lažnih preklapanja koja nastaju pri sastavljanju genoma","Floreani, Filip",,,,,,,,
fer:2565,thesis,"Utjecaj susjeda na vlastito mišljenje","Bestvina, Ivan",,,,,,,,
fer:3333,thesis,"dna2vec: vektorska reprezentacija k-torki različite duljine","Kutnjak, Mateo",,,,,,,,
fer:1116,thesis,"Poravnanje dugačkih RNA očitanja","Jurić, Antonio",,,,,,,,
fer:2124,thesis,"Izgradnja distribucije Linuxa korištenjem okoline Yocto","Šimić, Valerija",,,,,,,,
fer:1347,thesis,"Prijenosni sustav za električnu kapacitivnu tomografiju","Lasić, Ivan",,,,,,,,
fer:1291,thesis,"Poravnanje RNA očitanja na poznate gene","Krpelnik, Ivan",,,,,,,,
fer:2146,thesis,"Stablo Bloomovih filtara za spremanje sljedova","Škugor, Luka",,,,,,,,
fer:4530,thesis,"Sustav potpore odlučivanju za predviđanje i optimalnu nabavu","Miculinić, Neven",,,,,,,,
fer:1551,thesis,"Međuprocesna komunikacija temeljena na redovima poruka","Mihelčić, Velimir",,,,,,,,
fer:1475,thesis,"Programska potpora za analizu značajki fizioloških reakcija na emocionalne podražaje primjenom statističkih metoda i strojnog učenja","Marković, Tomislav",,,,,,,,
fer:2352,thesis,"Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem tehnologijom nanopora u realnom vremenu","Vujević, Ivan",,,,,,,,
fer:1553,thesis,"Odredivost nultog pacijenta ovisno o njegovoj poziciji u mreži","Miholić, Iva",,,,,,,,
fer:1642,thesis,"Implementacija web poslužitelja u programskom jeziku Erlang","Nenadić, Mate",,,,,,,,
fer:1224,thesis,"De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom","Kostelac, Mario",,,,,,,,
fer:4859,dissertation,"Algorithms for de novo genome assembly from third generation sequencing data","Sović, Ivan",,,,,,,,
fer:2166,thesis,"EAGLER - Popravljanje već sastavljenih genoma koristeći dugačka očitanja","Šterbić, Luka",,,,,,,,
fer:1001,thesis,"Reducirana baza gena za precizno određivanje vrsta","Humski, Dorija",,,,,,,,
fer:1900,thesis,"Alat za poravnanje dugačkih očitanja","Ratković, Marko",,,,,,,,
fer:401,thesis,"Generiranje konsenzusnog slijeda iz grafova djelomično uređenih višestrukih poravnanja","Baćac, Adriano",,,,,,,,
fer:957,thesis,"Poboljšano sufiksno polje","Hadviger, Antea",,,,,,,,
fer:1960,thesis,"Rekonstrukcija filogenetskog stabla koristeći metodu maksimalne uštede uz razgranaj-ograniči optimizaciju","Selak, Ana Marija",,,,,,,,
fer:1522,thesis,"Rekonstrukcija filogenetskog stabla koristeći metodu udruživanja susjeda","Megla, Lucija",,,,,,,,
fer:2099,thesis,"Sufiksno stablo","Šebrek, Tomislav",,,,,,,,
fer:1454,thesis,"Alat za mapiranje dugih očitanja dobivenih RNA sekvenciranjem","Marić, Josip",,,,,,,,
fer:2279,thesis,"De novo sastavljanje transkriptoma","Vaser, Robert",,,,,,,,
fer:1729,thesis,"Identifikacija RNA izoformi iz grafa transkripata","Pavlović, Dario",,,,,,,,
fer:677,thesis,"Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom","Čulinović, Marko",,,,,,,,
fer:4408,thesis,"Alat za globalno poravnavanje sekvenci","Žužić, Goran",,,,,,,,
fer:4934,dissertation,"Statistical inference algorithms for epidemic processes on complex networks","Antulov-Fantulin, Nino",,,,,,,,
fer:2154,thesis,"C/C++ biblioteka za dinamičko programiranje korištenjem SIMD instrukcija","Šošić, Martin",,,,,,,,
fer:2443,thesis,"Alat za poravnavanje genoma","Žuljević, Petar",,,,,,,,
fer:1827,thesis,"Sklopovska implementacija postupaka za poravnanje genoma","Polović, Marko",,,,,,,,
fer:2183,thesis,"Steganografija i vodeni žig u zaštiti digitalnih fotografija","Šumiga, Sandra",,,,,,,,
fer:348,thesis,"Alat za brzo pretraživanje baza proteinskih slijedova","Vujević, Ivan",,,,,,,,
fer:224,thesis,"Širenje informacija u društvenim mrežama","Miholić, Iva",,,,,,,,
fer:1090,thesis,"Alat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem","Jerković, Igor",,,,,,,,
fer:763,thesis,"De novo sastavljanje metagenomskih podataka korištenjem grupiranja podataka temeljenih na Bayesovom modelu","Dvorničić, Mirta",,,,,,,,
fer:2155,thesis,"Određivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka","Šošić, Matija",,,,,,,,
fer:1886,thesis,"Pojednostavljenje grafa preklapanja","Rahle, Bruno",,,,,,,,
fer:2446,thesis,"Računalne metode za poboljšanje i validaciju sastavljenih genoma","Županović, Vanessa",,,,,,,,
irb:40,dataset,"Detectability limits of epidemic sources in networks","Antulov-Fantulin, Nino; Lančić, Alen; Štefančić, Hrvoje; Šmuc, Tomislav; Šikić, Mile",,,,,,,,
fer:5332,dissertation,"Optimiranje sigurnosnih pravila vatrozida","Katić, Tihomir",,,,,,,,
fer:5307,dissertation,"Poboljšani algoritam za izbor i provjeru kvalitete najboljih multivarijacijskih modela odnosa strukture i svojstava molekula","Papeš Šokčević, Lidija",,,,,,,,
fer:6873,dissertation,"Računalna metoda za predviđanje mjesta proteinske interakcije","Šikić, Mile",,,,,,,,
fer:5110,dissertation,"Modeli naplate sadržaja u mobilnim paketskim mrežama","Šikić, Mile",,,,,,,,