prikaz prve stranice dokumenta Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije
No public access
undergraduate thesis
Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije
2017. urn:nbn:hr:168:349673
Rupe, Marina
University of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing

Cite this document

Rupe, M. (2017). Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije (Undergraduate thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349673

Rupe, Marina. "Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije." Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349673

Rupe, Marina. "Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije." Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349673

Rupe, M. (2017). 'Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije', Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, accessed 09 November 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349673

Rupe M. Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije [Undergraduate thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing; 2017 [cited 2024 November 09] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349673

M. Rupe, "Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije", Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, Zagreb, 2017. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349673

Please login to the repository to save this object to your list.
Metadata
TitleAnaliza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije
Title (english)Analysis of a Metagenomic Sample Obtained by Third Generation Sequencing Technology
AuthorMarina Rupe
MentorMile Šikić (mentor)
Committee memberMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Committee memberKrešimir Križanović (član povjerenstva)
Committee memberRobert Vaser (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing
Zagreb
Defense date and country2017-07-10, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		TECHNICAL SCIENCES
Computing
Abstract
Brza i jeftina analiza metagenomskog uzorka korisna je za kontrolu kvalitete hrane, dijagnozu bolesti i utvrd̄ivanje štetnih nametnika na biljkama. Tradicionalne labora- torijske metode su ili dugotrajne ili namijenjene za samo jednu vrstu. Korištenjem ured̄aja treće generacije dobivaju se očitanja koja su puno dulja, no sadrže i znatno veći postotak pogrešaka. Implementiran je alat koji utvrd̄uje koji su organizmi prisutni u metagenomskim uzorcima dobivenenima koristeći upravo ured̄aje treće generacije. Alat u prvom koraku pronalazi sve organizme čiji genetski materijal nalikuje očita- njima iz uzorka, a zatim u drugom koraku analizira rezultate iz prvog koraka i utvrd̄uje koji su organizmi prisutni u zadanom uzorku.
Abstract (english)
A fast and inexpensive analysis of metagenomic samples is useful for food quality control, medical diagnosis and identifying harmful plant parasites. Traditional labo- ratory methods are either time-consuming or designed for a specific species. Third- generation devices produce reads that are much longer, but also have a significantly higher error rate. A tool is implemented to determine which organisms are present in metagenomic samples obtained via third-generation devices. In its first step, the tool finds all organisms whose genetic material resembles that of the sample’s reads. Af- terwards, in the second step, the tool analyzes the first step’s results and determines which organisms are present in the given sample.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:168:349673
Study programmeTitle: Computing
Study programme type: university
Study level: undergraduate
Academic / professional title: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsClosed access
Terms of useLicence In copyright icon
Public note
Created on2019-03-14 00:33:22